Az endodontus a fogak gyökérkezelésével foglalkozik. Erre sor kerülhet élő, vagy már elhalt fogak esetében.

Az élő fogaknál a fogak devitalizálásával ( vagyis az ideg és ér csatornák elölésével) az élettelen fogaknál pedig a fertozött gyökércsatornák tisztításával, fertotlenítésével kezdodik a kezelés. Ezek után a megmunkált gyökércsatornák pontos és hermetikus tömése következik. A gyökérkezelés sokszor a legnehezebb fogorvosi feladatok egyike. Türelmet, pontosságot, precíz eszközöket, és sok idot igényel.